深化機構改革，是新時代面臨新任務新要求的政府職能轉型優化之需，是推進國家治理體系和治理能力現代化的必然要求，更是圍繞推動高質量發展、建設現代化經濟體系的有力之舉。
現代化經濟體系包括創新引領、協同發展的產業體系，統一開放、競爭有序的市場體系，彰顯優勢、協調聯動的城鄉區域發展體系，資源節約、環境友好的綠色發展體系，以及多元平衡、安全高效的全面開放體系等。整體來看，這次國家機構改革的重點領域和關鍵環節，更加契合建設現代化經濟體系的各方面要求。
首先，機構改革凸顯了創新發展和產權保護的重要性，為構建創新引領、協同發展的產業體系明晰了牽引主體。根據國務院機構改革方案，重新組建科學技術部，將科學技術部、國家外國專家局的職責整合，這將有利于統籌推進國家創新體系建設，強化戰略科技力量，優化配置科技資源。同時，重新組建國家知識產權局，將國家知識產權局的職責、國家工商行政管理總局的商標管理職責、國家質量監督檢驗檢疫總局的原產地地理標志管理職責整合，這將進一步推動知識產權保護體系建設。
其次，機構改革進一步強化市場監管效能，為建設統一開放、競爭有序的市場體系規范了治理主體。新組建的國家市場監督管理總局為實行統一市場監管、綜合執法、秩序規范創造條件，明晰了主體責任，形成大監管合力。
再次，機構改革高度重視自然資源和生態環境保護，為建設資源節約、環境友好的綠色發展體系提供了組織保障。新組建的自然資源部，將統一行使全民所有自然資源資產所有者職責，統一行使所有國土空間用途管制和生態保護修復職責，著力解決自然資源所有者不到位、空間規劃重疊等問題。新組建的生態環境部，將整合分散的生態環境保護職責，統一行使生態和城鄉各類污染排放監管與行政執法職責，加強環境污染治理，保障國家生態安全。
第四，機構改革著力關注“三農”工作和城鄉協調發展，為建設彰顯優勢、協調聯動的城鄉區域發展體系提供了職能機構保障。根據國務院機構改革方案，將農業部的職責，以及國家發展和改革委員會的農業投資項目、財政部的農業綜合開發項目、國土資源部的農田整治項目、水利部的農田水利建設項目等管理職責整合，組建農業農村部。新機構將為實施鄉村振興戰略、農業農村現代化、統籌城鄉協調發展提供有力保障。
第五，機構改革注重開放型經濟體制建設，為建設多元平衡、安全高效的全面開放體系提供實施保障。根據國務院機構改革方案，將商務部對外援助工作有關職責、外交部對外援助協調等職責整合，組建國家國際發展合作署，這一新機構將加強對外援助的戰略謀劃和統籌協調，更好地服務國家外交總體布局和共建“一帶一路”等。